Gerard Ekdom wist al vroeg wat hij wilde worden: diskjockey. Hij was er vroeg bij, want al op zijn 14e werd hij regelmatig gevraagd als drive-in jock. Als radio-dj begon hij bij het lokale Radio De Bilt. Ook werkte hij korte tijd bij Stadsomroep Utrecht en NEW Dance Radio. De plek bij Stadsomroep Utrecht had Ekdom grotendeels te danken aan dj Fred Siebelink. Ekdom kwam Siebelink op een dag tegen in Utrecht (hij herkende Siebelink aan diens stem), waar hij niet schroomde om hem aan te spreken. Siebelink zag wel wat in Ekdom en leidde hem rond bij de Stadsomroep. Na een tijdje werd het talent van Ekdom erkend en verdiende hij zo een plek bij de Stadsomroep. 

In 1998 begon Ekdom zijn carrière bij 3FM. Anderhalf jaar eerder al had hij een bandje opgestuurd naar de toenmalige manager Jan Steeman van het project Pyjama FM van de AVRO. Na een belletje van Steeman kon hij beginnen in de nachtopleiding bij de AVRO. In de tussentijd was hij ook nog te horen bij Magic FM en Hot Radio. In september 1999 verhuisde Ekdom van de nacht naar de zondagochtend en presenteerde hij het programma EKDOM!. Zijn echte doorbraak kwam zeven maanden later, toen hij twee weken mocht invallen voor het programma Arbeidsvitaminen. Dat beviel Ekdom en de AVRO goed. Daarna ging het snel. Hij kreeg nog eerst een eigen dagelijks nachtprogramma, maar op 17 september 2001 verving hij definitief Wim Rigter als vaste presentator van de Arbeidsvitaminen. Daar was hij elke werkdag te horen tussen eerst 09.00, later 10.00 en 12.00 uur en het is het best beluisterde programma van de zender. Gerard Ekdom staat bekend om een uitgebreide muziekkennis en zijn pogingen om tussen alle typische Arbeidsvitaminen-platen ook regelmatig een zogenaamde 'freakplaat' te pluggen. Ook kwam iedere dag het item 'Bedrijven Top 10' aan bod waarbij een bedrijf zijn top tien in stuurt en de baas wordt uitgeroepen tot 'Baas van de dag'. Op 3 september 2010 presenteerde Gerard Ekdom zijn laatste aflevering van Arbeidsvitaminen voordat het naar Radio 5 verhuisde. Vanaf 6 september 2010 presenteert hij van maandag tot en met donderdag tussen 12.00 uur en 14.00 uur Effe Ekdom. 

Naast Effe Ekdom presenteert hij op zaterdagochtend tussen 04.00 en 07.00 uur het programma Ekdom In De Nacht dat samen met Nachtegiel van Giel Beelen onderdeel uitmaakt van de Freaknacht. Sinds september 2006 is hij samen met Michiel Veenstra ook op vrijdagavond van 19.00 uur tot 22.00 uur te horen in het het programma Ekstra Weekend. In oktober 2008 verscheen zijn autobiografie, getiteld Ik Zal Kijken Wat Ik Voor Je Kan Doen. De titel is een verwijzing naar een van Ekdoms bekende vaste uitspraken. Op 1 december 2011 won Ekdom samen met Michiel Veenstra de De Gouden RadioRing voor Ekstra Weekend en persoonlijk de Zilveren RadioSter (man) voor beste radiopresentator tijdens het Het RadioGala van het Jaar.  

3FM Serious Request  

Gerard Ekdom is al jaren een vaste waarde om de week voor Kerst in het zogeheten glazen huis plaats te nemen. Zo ook in 2011 is hij eveneens weer aanwezig in het glazen huis in Leiden, samen met Coen Swijnenberg en Timur Perlin. Bij 3FM Serious Request is het een vast gegeven geworden dat Ekdom Living Doll van Cliff Richard and The Young Ones playbackt, uiteraard tegen een kleine donatie voor het goede doel!!!